Além dos microscópios e das placas de Petri, os computadores são uma ferramenta importante para os microbiologistas. O software para pesquisa de microbiologia inclui ferramentas usadas por outras disciplinas científicas e de engenharia, bem como aplicativos especializados para o estudo de bactérias e outros microrganismos. Muitos aplicativos desenvolvidos por agências governamentais, fundações sem fins lucrativos ou pesquisadores acadêmicos estão disponíveis como software gratuito para download e uso conforme sua experiência ou laboratório exigir.
Ferramentas de visualização
Uma imagem física ou mental dos dados brutos que você coleta pode ajudá-lo a compreender melhor sua qualidade, significado e implicações. O software de visualização de dados comerciais e de código aberto está amplamente disponível para pesquisas em microbiologia. Crie tabelas e gráficos de seus dados usando o LibreOffice Calc, o Excel da Microsoft ou o sistema de visualização de dados Mondrian. Os aplicativos Cell-O e RasMol ajudam a criar modelos animados em 2D e 3D de moléculas biologicamente significativas, como proteínas e aminoácidos.
Modelagem matemática
Grandes coleções de dados de microbiologia geralmente fornecem informações mais significativas, uma vez que foram analisadas numericamente. Pacotes de software MATLAB, Octave e SciPy que realizam refinamento matemático, análise e modelagem de dados de cientistas. Use esses pacotes para fazer estimativas de parâmetros por meio de ajuste de curva, previsões epidemiológicas, simulações de crescimento bacteriano e ruído de dados ou eliminação de efeito estocástico. Esse aplicativo também executa cálculos estatísticos, como análise de variância ou testes de qui-quadrado.
Genoma Bioinformática
Os aplicativos de software de microbiologia também ajudam a visualizar e extrair informações da sequência de ácidos nucléicos que compõem o DNA de um microrganismo. A Open Bioinformatics Foundation fornece aplicativos de sequenciamento e análise de DNA de código aberto gratuitos, como o BioJava e o Biopython, que extraem dados de bancos de informações do genoma, analisam o código de DNA de um organismo e o comparam com outras amostras de DNA. Pacotes adicionais de análise de genoma incluem Emboss, HMMER, Clustal Omega, Phylogeny Inference Package ou PHYLIP e o Sequence Manipulation Suite ou SMS.
Software de Referência
O ritmo acelerado das descobertas científicas em microbiologia e as mudanças nas regulamentações governamentais tornam essencial que os microbiologistas tenham acesso imediato às informações que impactam seu trabalho. HUGO é um pacote de software comercial que fornece aos microbiologistas informações atuais sobre ferramentas, produtos químicos, equipamentos, meios de cultura, requisitos de segurança, novos organismos, alterações taxonômicas e antibióticos. Além disso, os microbiologistas que trabalham na ciência de alimentos podem usar o aplicativo ComBase Browser Web para acessar os dados microbiológicos relacionados a alimentos fornecidos por agências governamentais no Reino Unido, Austrália e Estados Unidos.
